Karen blev gift med Bernt Lauritsen Krag, søn af Lauritz Jespersen og Maren Hansdatter Krag.
Der kendes fem børn i Karen Købkes ægteskab med Bernt Lauritzen Krag: Hans Knudsen Krag, født 1722 i Kølstrup, han fik borgerskab i Odense på sin handel med ostindiske og guineiske varer, desuden var han kromand og brændevinsbrænder.
De øvrige børn var tvillingerne Poul Bagger Krag og Otte Jensen Krag, der blev født i 1723 samt tvillingerne Friderich Krag og Frantz Krag, der fødtes i 1724 i Kølstrup.
Efter Karen Købkes død i 1725, giftede Bernt Lauritzen Krag sig 1727 med Susanne Andersdatter Jungshoved, der var enke, da hun i 1743 giftede sig igen.
